Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc71Q8VEG0 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms