Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ubxn4Q8VCH8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn4Q8VCH8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn4Q8VCH8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn4Q8VCH8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn4Q8VCH8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn4Q8VCH8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn4Q8VCH8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn4Q8VCH8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn4Q8VCH8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn4Q8VCH8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn4Q8VCH8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn4Q8VCH8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn4Q8VCH8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn4Q8VCH8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn4Q8VCH8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn4Q8VCH8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn4Q8VCH8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn4Q8VCH8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn4Q8VCH8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubxn4Q8VCH8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn4Q8VCH8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn4Q8VCH8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn4Q8VCH8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn4Q8VCH8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn4Q8VCH8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn4Q8VCH8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn4Q8VCH8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn4Q8VCH8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubxn4Q8VCH8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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