Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r200Q8R281 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r200Q8R281 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r200Q8R281 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r200Q8R281 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r200Q8R281 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r200Q8R281 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r200Q8R281 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r200Q8R281 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r200Q8R281 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r200Q8R281 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r200Q8R281 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r200Q8R281 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r200Q8R281 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r200Q8R281 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r200Q8R281 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r200Q8R281 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r200Q8R281 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r200Q8R281 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r200Q8R281 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r200Q8R281 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r200Q8R281 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r200Q8R281 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r200Q8R281 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r200Q8R281 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r200Q8R281 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r200Q8R281 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Vmn1r200Q8R281 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r200Q8R281 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r200Q8R281 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r200Q8R281 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r200Q8R281 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r200Q8R281 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Vmn1r200Q8R281 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r200Q8R281 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r200Q8R281 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r200Q8R281 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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Vmn1r200Q8R281 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r200Q8R281 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
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Vmn1r200Q8R281 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r200Q8R281 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r200Q8R281 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Vmn1r200Q8R281 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r200Q8R281 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Vmn1r200Q8R281 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r200Q8R281 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r200Q8R281 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Vmn1r200Q8R281 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Vmn1r200Q8R281 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Vmn1r200Q8R281 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Vmn1r200Q8R281 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r200Q8R281 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r200Q8R281 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r200Q8R281 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r200Q8R281 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r200Q8R281 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r200Q8R281 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r200Q8R281 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r200Q8R281 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r200Q8R281 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r200Q8R281 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r200Q8R281 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r200Q8R281 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r200Q8R281 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r200Q8R281 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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