Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1Q0

Stx19, Syntaxin-19, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx19Q8R1Q0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx19Q8R1Q0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx19Q8R1Q0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx19Q8R1Q0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx19Q8R1Q0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx19Q8R1Q0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx19Q8R1Q0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx19Q8R1Q0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx19Q8R1Q0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx19Q8R1Q0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx19Q8R1Q0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx19Q8R1Q0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx19Q8R1Q0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx19Q8R1Q0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx19Q8R1Q0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx19Q8R1Q0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx19Q8R1Q0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx19Q8R1Q0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx19Q8R1Q0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx19Q8R1Q0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx19Q8R1Q0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx19Q8R1Q0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx19Q8R1Q0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx19Q8R1Q0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx19Q8R1Q0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx19Q8R1Q0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms