Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CipcQ8R0W1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CipcQ8R0W1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms