Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms