Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rasgef1bQ8JZL7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rasgef1bQ8JZL7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rasgef1bQ8JZL7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rasgef1bQ8JZL7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rasgef1bQ8JZL7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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