Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TwnkQ8CIW5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TwnkQ8CIW5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TwnkQ8CIW5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TwnkQ8CIW5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TwnkQ8CIW5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TwnkQ8CIW5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TwnkQ8CIW5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TwnkQ8CIW5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TwnkQ8CIW5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TwnkQ8CIW5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TwnkQ8CIW5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TwnkQ8CIW5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TwnkQ8CIW5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TwnkQ8CIW5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TwnkQ8CIW5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TwnkQ8CIW5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TwnkQ8CIW5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TwnkQ8CIW5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TwnkQ8CIW5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TwnkQ8CIW5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TwnkQ8CIW5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TwnkQ8CIW5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TwnkQ8CIW5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TwnkQ8CIW5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TwnkQ8CIW5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TwnkQ8CIW5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TwnkQ8CIW5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TwnkQ8CIW5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TwnkQ8CIW5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TwnkQ8CIW5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TwnkQ8CIW5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TwnkQ8CIW5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TwnkQ8CIW5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms