Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIL4

Uncharacterized protein C1orf131 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CIL4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8CIL4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8CIL4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8CIL4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8CIL4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8CIL4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8CIL4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8CIL4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8CIL4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8CIL4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8CIL4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8CIL4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8CIL4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8CIL4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8CIL4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8CIL4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8CIL4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8CIL4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8CIL4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8CIL4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8CIL4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8CIL4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8CIL4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8CIL4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8CIL4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8CIL4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8CIL4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8CIL4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8CIL4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8CIL4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8CIL4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8CIL4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8CIL4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8CIL4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8CIL4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8CIL4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8CIL4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8CIL4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8CIL4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8CIL4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8CIL4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8CIL4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8CIL4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms