Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFW7

Cc2d2a, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cc2d2aQ8CFW7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cc2d2aQ8CFW7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cc2d2aQ8CFW7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cc2d2aQ8CFW7 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cc2d2aQ8CFW7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cc2d2aQ8CFW7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cc2d2aQ8CFW7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cc2d2aQ8CFW7 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cc2d2aQ8CFW7 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cc2d2aQ8CFW7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cc2d2aQ8CFW7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cc2d2aQ8CFW7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cc2d2aQ8CFW7 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cc2d2aQ8CFW7 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cc2d2aQ8CFW7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cc2d2aQ8CFW7 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cc2d2aQ8CFW7 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cc2d2aQ8CFW7 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Cc2d2aQ8CFW7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cc2d2aQ8CFW7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cc2d2aQ8CFW7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms