Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Usp27Q8CEG8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp27Q8CEG8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp27Q8CEG8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp27Q8CEG8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp27Q8CEG8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Usp27Q8CEG8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp27Q8CEG8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp27Q8CEG8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Usp27Q8CEG8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp27Q8CEG8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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