Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms