Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6E1

Apol7c, Apolipoprotein L 7c, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7cQ8C6E1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apol7cQ8C6E1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms