Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q8C5C9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q8C5C9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Q8C5C9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q8C5C9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q8C5C9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q8C5C9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q8C5C9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms