Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

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Length 938 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Hdac7Q8C2B3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Hdac7Q8C2B3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Hdac7Q8C2B3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Hdac7Q8C2B3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Hdac7Q8C2B3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Hdac7Q8C2B3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Hdac7Q8C2B3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Hdac7Q8C2B3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Hdac7Q8C2B3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hdac7Q8C2B3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms