Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg16l1Q8C0J2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg16l1Q8C0J2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms