Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXZ0

Ctxn3, Cortexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn3Q8BXZ0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctxn3Q8BXZ0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctxn3Q8BXZ0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctxn3Q8BXZ0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctxn3Q8BXZ0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctxn3Q8BXZ0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctxn3Q8BXZ0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctxn3Q8BXZ0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctxn3Q8BXZ0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctxn3Q8BXZ0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctxn3Q8BXZ0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctxn3Q8BXZ0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctxn3Q8BXZ0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctxn3Q8BXZ0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctxn3Q8BXZ0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctxn3Q8BXZ0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctxn3Q8BXZ0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctxn3Q8BXZ0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctxn3Q8BXZ0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctxn3Q8BXZ0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctxn3Q8BXZ0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctxn3Q8BXZ0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctxn3Q8BXZ0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctxn3Q8BXZ0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctxn3Q8BXZ0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctxn3Q8BXZ0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctxn3Q8BXZ0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctxn3Q8BXZ0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctxn3Q8BXZ0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctxn3Q8BXZ0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctxn3Q8BXZ0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctxn3Q8BXZ0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctxn3Q8BXZ0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctxn3Q8BXZ0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctxn3Q8BXZ0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctxn3Q8BXZ0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctxn3Q8BXZ0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctxn3Q8BXZ0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctxn3Q8BXZ0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctxn3Q8BXZ0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctxn3Q8BXZ0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctxn3Q8BXZ0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctxn3Q8BXZ0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctxn3Q8BXZ0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctxn3Q8BXZ0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctxn3Q8BXZ0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctxn3Q8BXZ0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctxn3Q8BXZ0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctxn3Q8BXZ0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctxn3Q8BXZ0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctxn3Q8BXZ0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctxn3Q8BXZ0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctxn3Q8BXZ0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctxn3Q8BXZ0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctxn3Q8BXZ0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctxn3Q8BXZ0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctxn3Q8BXZ0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctxn3Q8BXZ0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctxn3Q8BXZ0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctxn3Q8BXZ0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctxn3Q8BXZ0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctxn3Q8BXZ0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctxn3Q8BXZ0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctxn3Q8BXZ0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctxn3Q8BXZ0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctxn3Q8BXZ0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctxn3Q8BXZ0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctxn3Q8BXZ0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctxn3Q8BXZ0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctxn3Q8BXZ0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctxn3Q8BXZ0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctxn3Q8BXZ0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctxn3Q8BXZ0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctxn3Q8BXZ0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctxn3Q8BXZ0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctxn3Q8BXZ0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctxn3Q8BXZ0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctxn3Q8BXZ0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctxn3Q8BXZ0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctxn3Q8BXZ0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctxn3Q8BXZ0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctxn3Q8BXZ0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctxn3Q8BXZ0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctxn3Q8BXZ0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctxn3Q8BXZ0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctxn3Q8BXZ0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctxn3Q8BXZ0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctxn3Q8BXZ0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctxn3Q8BXZ0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctxn3Q8BXZ0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctxn3Q8BXZ0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctxn3Q8BXZ0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctxn3Q8BXZ0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctxn3Q8BXZ0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctxn3Q8BXZ0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctxn3Q8BXZ0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctxn3Q8BXZ0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctxn3Q8BXZ0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctxn3Q8BXZ0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctxn3Q8BXZ0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms