Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tnfsfm13Q8BXS2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tnfsfm13Q8BXS2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tnfsfm13Q8BXS2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tnfsfm13Q8BXS2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tnfsfm13Q8BXS2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tnfsfm13Q8BXS2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tnfsfm13Q8BXS2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms