Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pdcl3Q8BVF2 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdcl3Q8BVF2 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms