Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSU2

Cxcl16, C-X-C motif chemokine 16, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl16Q8BSU2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cxcl16Q8BSU2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cxcl16Q8BSU2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cxcl16Q8BSU2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Cxcl16Q8BSU2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cxcl16Q8BSU2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Cxcl16Q8BSU2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cxcl16Q8BSU2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cxcl16Q8BSU2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cxcl16Q8BSU2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cxcl16Q8BSU2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cxcl16Q8BSU2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Cxcl16Q8BSU2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl16Q8BSU2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl16Q8BSU2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl16Q8BSU2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl16Q8BSU2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl16Q8BSU2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl16Q8BSU2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl16Q8BSU2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl16Q8BSU2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl16Q8BSU2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl16Q8BSU2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl16Q8BSU2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl16Q8BSU2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl16Q8BSU2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl16Q8BSU2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl16Q8BSU2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl16Q8BSU2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl16Q8BSU2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl16Q8BSU2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl16Q8BSU2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl16Q8BSU2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl16Q8BSU2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl16Q8BSU2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl16Q8BSU2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl16Q8BSU2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl16Q8BSU2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl16Q8BSU2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl16Q8BSU2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl16Q8BSU2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcl16Q8BSU2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcl16Q8BSU2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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