Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Prpf18Q8BM39 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Prpf18Q8BM39 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prpf18Q8BM39 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prpf18Q8BM39 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prpf18Q8BM39 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prpf18Q8BM39 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Prpf18Q8BM39 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Prpf18Q8BM39 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Prpf18Q8BM39 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf18Q8BM39 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf18Q8BM39 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Prpf18Q8BM39 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf18Q8BM39 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf18Q8BM39 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf18Q8BM39 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf18Q8BM39 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf18Q8BM39 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf18Q8BM39 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf18Q8BM39 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf18Q8BM39 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf18Q8BM39 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf18Q8BM39 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf18Q8BM39 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf18Q8BM39 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf18Q8BM39 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf18Q8BM39 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf18Q8BM39 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf18Q8BM39 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf18Q8BM39 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf18Q8BM39 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Prpf18Q8BM39 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf18Q8BM39 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf18Q8BM39 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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