Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL74

Gtf3c2, General transcription factor 3C polypeptide 2, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c2Q8BL74 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17■□□□□ 0.31
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Gtf3c2Q8BL74 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Gtf3c2Q8BL74 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Gtf3c2Q8BL74 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Gtf3c2Q8BL74 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Gtf3c2Q8BL74 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Gtf3c2Q8BL74 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Gtf3c2Q8BL74 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Gtf3c2Q8BL74 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf3c2Q8BL74 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms