Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gabra5Q8BHJ7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms