Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg4bQ8BGE6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg4bQ8BGE6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms