Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Htatsf1Q8BGC0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Htatsf1Q8BGC0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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