Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW7

H2-M10.5, Histocompatibility 2, M region locus 10.5, mousemouse

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.5Q85ZW7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M10.5Q85ZW7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M10.5Q85ZW7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M10.5Q85ZW7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M10.5Q85ZW7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M10.5Q85ZW7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M10.5Q85ZW7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-M10.5Q85ZW7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M10.5Q85ZW7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M10.5Q85ZW7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M10.5Q85ZW7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M10.5Q85ZW7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M10.5Q85ZW7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M10.5Q85ZW7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M10.5Q85ZW7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M10.5Q85ZW7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M10.5Q85ZW7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M10.5Q85ZW7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M10.5Q85ZW7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M10.5Q85ZW7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M10.5Q85ZW7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M10.5Q85ZW7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M10.5Q85ZW7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M10.5Q85ZW7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M10.5Q85ZW7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M10.5Q85ZW7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M10.5Q85ZW7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M10.5Q85ZW7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M10.5Q85ZW7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M10.5Q85ZW7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M10.5Q85ZW7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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H2-M10.5Q85ZW7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-M10.5Q85ZW7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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H2-M10.5Q85ZW7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2-M10.5Q85ZW7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2-M10.5Q85ZW7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2-M10.5Q85ZW7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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H2-M10.5Q85ZW7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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H2-M10.5Q85ZW7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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H2-M10.5Q85ZW7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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H2-M10.5Q85ZW7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M10.5Q85ZW7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M10.5Q85ZW7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M10.5Q85ZW7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M10.5Q85ZW7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M10.5Q85ZW7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M10.5Q85ZW7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M10.5Q85ZW7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M10.5Q85ZW7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M10.5Q85ZW7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M10.5Q85ZW7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M10.5Q85ZW7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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H2-M10.5Q85ZW7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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H2-M10.5Q85ZW7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M10.5Q85ZW7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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