Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn34b3Q80ZS5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34b3Q80ZS5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34b3Q80ZS5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34b3Q80ZS5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34b3Q80ZS5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34b3Q80ZS5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34b3Q80ZS5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34b3Q80ZS5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34b3Q80ZS5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34b3Q80ZS5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34b3Q80ZS5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34b3Q80ZS5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34b3Q80ZS5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34b3Q80ZS5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34b3Q80ZS5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34b3Q80ZS5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34b3Q80ZS5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34b3Q80ZS5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34b3Q80ZS5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34b3Q80ZS5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34b3Q80ZS5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34b3Q80ZS5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34b3Q80ZS5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34b3Q80ZS5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34b3Q80ZS5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34b3Q80ZS5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34b3Q80ZS5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34b3Q80ZS5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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Cldn34b3Q80ZS5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34b3Q80ZS5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Cldn34b3Q80ZS5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Cldn34b3Q80ZS5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Cldn34b3Q80ZS5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34b3Q80ZS5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34b3Q80ZS5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34b3Q80ZS5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34b3Q80ZS5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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Cldn34b3Q80ZS5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34b3Q80ZS5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34b3Q80ZS5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34b3Q80ZS5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34b3Q80ZS5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34b3Q80ZS5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34b3Q80ZS5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34b3Q80ZS5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34b3Q80ZS5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34b3Q80ZS5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34b3Q80ZS5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn34b3Q80ZS5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn34b3Q80ZS5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn34b3Q80ZS5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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