Protein–RNA interactions for Protein: Q80XC6

Nrde2, Protein NRDE2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrde2Q80XC6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrde2Q80XC6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms