Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Ttc29Q80VM3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Ttc29Q80VM3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Ttc29Q80VM3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc29Q80VM3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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