Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms