Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccp110Q7TSH4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccp110Q7TSH4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccp110Q7TSH4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccp110Q7TSH4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccp110Q7TSH4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccp110Q7TSH4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccp110Q7TSH4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccp110Q7TSH4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccp110Q7TSH4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccp110Q7TSH4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccp110Q7TSH4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccp110Q7TSH4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccp110Q7TSH4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccp110Q7TSH4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccp110Q7TSH4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccp110Q7TSH4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccp110Q7TSH4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccp110Q7TSH4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccp110Q7TSH4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccp110Q7TSH4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms