Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf653Q6YND2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms