Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tfap2eQ6VUP9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms