Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY52

Gm7247, Predicted gene 7247, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7247Q6UY52 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm7247Q6UY52 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm7247Q6UY52 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm7247Q6UY52 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm7247Q6UY52 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm7247Q6UY52 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm7247Q6UY52 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm7247Q6UY52 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm7247Q6UY52 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm7247Q6UY52 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm7247Q6UY52 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm7247Q6UY52 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms