Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc154Q6RUT8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms