Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms