Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms