Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slx4Q6P1D7 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Slx4Q6P1D7 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slx4Q6P1D7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slx4Q6P1D7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slx4Q6P1D7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slx4Q6P1D7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Slx4Q6P1D7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slx4Q6P1D7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slx4Q6P1D7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slx4Q6P1D7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slx4Q6P1D7 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Slx4Q6P1D7 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slx4Q6P1D7 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Slx4Q6P1D7 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Slx4Q6P1D7 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slx4Q6P1D7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slx4Q6P1D7 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slx4Q6P1D7 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slx4Q6P1D7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slx4Q6P1D7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slx4Q6P1D7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slx4Q6P1D7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slx4Q6P1D7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slx4Q6P1D7 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Slx4Q6P1D7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slx4Q6P1D7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slx4Q6P1D7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slx4Q6P1D7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slx4Q6P1D7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slx4Q6P1D7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slx4Q6P1D7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slx4Q6P1D7 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slx4Q6P1D7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slx4Q6P1D7 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slx4Q6P1D7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slx4Q6P1D7 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Slx4Q6P1D7 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slx4Q6P1D7 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slx4Q6P1D7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slx4Q6P1D7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slx4Q6P1D7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slx4Q6P1D7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slx4Q6P1D7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slx4Q6P1D7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms