Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Asic1Q6NXK8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Asic1Q6NXK8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Asic1Q6NXK8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Asic1Q6NXK8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Asic1Q6NXK8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Asic1Q6NXK8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Asic1Q6NXK8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Asic1Q6NXK8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Asic1Q6NXK8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Asic1Q6NXK8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Asic1Q6NXK8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Asic1Q6NXK8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Asic1Q6NXK8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Asic1Q6NXK8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms