Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sohlh1Q6IUP1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms