Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arhgap20Q6IFT4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms