Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrrcc1Q69ZB0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrcc1Q69ZB0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrcc1Q69ZB0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrcc1Q69ZB0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrcc1Q69ZB0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrcc1Q69ZB0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrcc1Q69ZB0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrcc1Q69ZB0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrcc1Q69ZB0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrcc1Q69ZB0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrcc1Q69ZB0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrcc1Q69ZB0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrcc1Q69ZB0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrcc1Q69ZB0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrcc1Q69ZB0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrcc1Q69ZB0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrcc1Q69ZB0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrcc1Q69ZB0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrcc1Q69ZB0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrcc1Q69ZB0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrcc1Q69ZB0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrcc1Q69ZB0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms