Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z98

Brsk2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, mousemouse

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brsk2Q69Z98 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brsk2Q69Z98 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms