Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms