Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnna3Q65CL1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnna3Q65CL1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms