Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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PtprdQ64487 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprdQ64487 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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PtprdQ64487 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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PtprdQ64487 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprdQ64487 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprdQ64487 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprdQ64487 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprdQ64487 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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PtprdQ64487 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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PtprdQ64487 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprdQ64487 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprdQ64487 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprdQ64487 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprdQ64487 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprdQ64487 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprdQ64487 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprdQ64487 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprdQ64487 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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PtprdQ64487 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprdQ64487 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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PtprdQ64487 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprdQ64487 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprdQ64487 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms