Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim24Q64127 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim24Q64127 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms