Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Polr2kQ63871 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms