Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sycp1Q62209 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms