Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SspnQ62147 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SspnQ62147 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SspnQ62147 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SspnQ62147 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SspnQ62147 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SspnQ62147 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SspnQ62147 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SspnQ62147 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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